中国科研人员揭示水稻基因组中的“隐藏”变异

中新社成都5月29日电 (贺劭清 张喆)记者29日从四川农业大学获悉，四川农业大学国家重点实验室、水稻研究所李仕贵与钦鹏教授团队联合中科院遗传与发育生物学研究所梁承志研究员团队分析揭示了水稻基因组中的“隐藏”变异。

这一研究成果以《基于33个水稻遗传多样性材料的泛基因组分析揭示“隐藏”的基因组变异》为题，于北京时间28日深夜由国际著名学术期刊《细胞》(Cell)在线发表。

四川农业大学和中科院团队选取了具有高度代表性的33个水稻材料，采用最新的第三代基因测序技术，对其中31份材料进行了长片段测序、高质量基因组组装及基因注释。结合已报道的日本晴和蜀恢498两个材料的参考基因组，经过系统的比较分析，共鉴定到171072个基因结构性变异和22549个基因拷贝数变异。

这些基因组变异无法利用传统手段鉴定到，绝大多数在先前研究中均未被发现，但在重要农艺性状调控中发挥重要作用。如著名优质稻品种“越光”中一个早熟位点(qDTH7-3)，很可能就是由OsMADS18基因在“越光”产生两个拷贝，导致基因表达量升高从而表现早熟表型。

此次研究过程中，中国科研人员还首次构建了水稻图形基因组，是水稻中迄今最为完整的基于图形结构的泛基因组。为了方便广大研究人员使用相关数据，他们还搭建了网站，便于使用基因组序列和查询遗传变异等内容，促进水稻功能基因组学和育种应用研究。

李仕贵表示，此研究打开了结构变异研究的大门，将有助于加速水稻功能基因组学和分子设计育种研究，为选育高产优质、绿色安全水稻新品种提供基础支撑。接下来团队将把研究成果运用到应用基础研究和育种工作中，力争培育出更多产量高、品质好、抗性强的水稻品种。